有的读者老爷好像没看过时拉比的剧场版，所以有点看不懂前面的剧情，我可以简单概括一下。
以下内容包含剧场版的剧透，已经看过，或者是想自己看的读者老爷不要再往下看了哦。
剧场版的主角之一名叫雪成，也就是大木博士小时候。
某天他来到一座森林写生，在森林的入口遇到了少女“永久”。
永久给了雪成“如果你听到了森林的声音，就不能乱走动”的忠告。
雪成表示这都不是事，然后走进了森林。
结果他就在森林里听到了这道声音，还遇到了被猎人追捕的时拉比。
为了保护时拉比，雪成被“穿梭时空的力量”卷入，带到了40年后的未来。
在40年后的世界，雪成认识了小智一行人，并且通过将时拉比放入生命之湖，使其恢复健康的方式获得了时拉比的信任。
但是在这世界里，号称火箭队最强干部的面具比夏斯正打算捕猎时拉比。
比夏斯拥有能将一切宝可梦变得凶恶的黑暗球，将时拉比从小智他们的身边夺走。
为了拯救被比夏斯捕捉的时拉比，小智与雪成拼命奋战，最终让时拉比摆脱了黑暗球的控制。
然而时拉比因为黑暗球的暴走变得极度的虚弱，又因为生命之湖被污染了，所以即使再次将时拉比放入湖水中，也依旧没能恢复。
小智一行人想起某位不愿意透露姓名的神兽之耻可以净化湖水。
水君也适时地出现了，生命之湖的湖水恢复了正常，只是时拉比受到了太多的伤害，即使是生命之湖也不能治愈时拉比。
就在小智等人和森林里的宝可梦伤心哭泣时，“森林的声音”再次显现。
许多的时拉比出现在了生命之湖的上空，它们恢复了这只时拉比的生命。
危险结束后，雪成和小智不舍地告别，与时拉比共同回到了40年前。
而小智一行人也离开了生命之湖所在的森林，继续踏上旅程。
大体情节就是这样，那为什么说雪成就是大木博士呢。
因为在结尾的片段中，小健打扫书房时，发现了一本素描画册，其中一张素描画正是雪成画的时拉比和皮卡丘。
而且在删减片段中，小智给大木博士打电话，明明没有提雪成的名字，大木博士却说“我相信你和雪成永远都是朋友。”
打完电话后，大木博士还一脸怀念地翻阅了童年所画的作品，足以证明雪成正是大木博士。
这个剧场版也能解释大木博士为什么对小智这么好，绝不是大家调侃的小智父亲什么的，而是他俩有着过命的交情。
也许皮卡丘都是大木博士特地给小智准备的，因为他知道小智未来的伙伴是皮卡丘。